Hemoroidektomi, hemoroid dokusunun kesilip çıkarılması işlemidir. Evre 3 ve 4 eksternal ve internal hemoroidlerde tercih edilir. Operasyon sırasında, neşter, makas, koter, ligasure ve lazer kullanılabilir. Hemoroid pakesi çıkarılırken, anüse ait hassas cilt dokusu da bir miktar çıkarılacağından, hastanın operasyon sonrası orta şiddette bir ağrı çekmesi olağandır. Uygun teknik ve iyi planlanarak uygulanmış bir cerrahi bu postoperatif şikayetlerin oldukça hafif seyretmesini sağlayacaktır. Kapalı ve açık hemoroidektomi olmak üzere iki çeşittir. Açık teknikte, genişlemiş hemoroid pakeleri tek tek ayrılarak, üstteki mukoza ile birlikte çıkarılır, mukozasız alan mukoza flepleriyle kapatılmaz. Kapalı teknikte ise tek fark mukozasız çıplak alanların mukoza flepleriyle kapatılmasıdır. Hemoroidektomi ameliyatı sonrası kişiye hekim tarafından, ağızdan alınan ağrı kesiciler, sıcak oturma banyoları, çeşitli pomadlar önerilecek, bunların düzenli kullanılması durumunda kişi yaklaşık 10 gün içerisinde günlük rutinine geri dönebilecektir.
Hemoroid ameliyatı sonrası en sık görülen şikayet ağrıdır. Hastaların %20 kadarında ameliyata bağlı geçici idrar yapma zorluğu görülebilir, bazı durumlarda idrar sondası yardımı ile idrar boşaltılabilir. Ameliyattan sonraki ilk birkaç gün hasta dışkılamakta çekingen davranabilir, buna bağlı kabızlık gelişir, üç gün içinde düzelmezse laksatifler kullanılabilir. Ameliyat yerlerinde tam kapanamama, dikişlerin açılması ve enfeksiyon gibi etkenlere bağlı olarak kanama görülebilir. Küçük deri çıkıntılarının kalması ve hemoroidin makattan sarkmaya devam etmesi görülebilir. Bazı hastalarda nadiren makat darlığı gelişir. Yine bazı hastalarda anal fistül ve fissür gelişebilir.Sfinkterektomi yapılan yaşlı hastalarda dışkı veya gaz kaçırma görülebilir. Çoğu hastada enfeksiyon gelişmez, ancak enfeksiyon korkusuyla makat aşırı temizlenmeye çalışılırsa kaşıntı şikayeti gelişebilir.
Hemoroid ameliyatı sonrası ağrı ve diğer şikayetlerin gözlenmesi ve hastanın gözlem altında tutulması için hastanın bir gece hastanede yatışı istenir. Ertesi gün hasta hekimin kontrolünde ve tekrar muayeneye gelmek üzere taburcu edilir.